Zur organisatorischen und wirtschaftlichen Abwicklung der VÖK-Agenden wurde 2015 die VÖK Fortbildungs GmbH gegründet, welche im 100% Eigentum der VÖK steht. Die GmbH hat ihren Sitz am Vereinssitz in Fischlham und erfüllt ihre Aufgaben mit Hilfe des VÖK-Organisationsbüros.
Die handelsrechtliche sowie die gewerberechtliche Geschäftsführung besorgt seit 2017 Priv.Doz. MMag.Dr. Alexander Tritthart, LL.M.

Die VÖK Fortbildungs-GmbH hat folgende Tätigkeitsbereiche:
o    Abwicklung der unterjährigen Seminare und Workshops
o    Abwicklung der Jahrestagung in Salzburg
o    Abwicklung der VET AUSTRIA in Salzburg
o    Betrieb Fachbuchhandlung VÖK BOOK
o    Betrieb der Tierkennzeichnungsdatenbank animaldata.com

Die VÖK Fortbildungs GmbH ist certNÖ und ö-cert zertifiziert und damit die einzige Fortbildungsanbieterin im Bereich der Veterinärmedizin in Österreich, die auf ein zertifiziertes Qualitätsmanagementsystem verweisen kann.